《亚刻奥特曼日语》的故事背景设定在一个名为星元市的小城市，这座城市坐落在雄伟的狮子尾山脚下。在这座山的巅峰，矗立着一个闪耀着五彩光芒的巨大物体，名为“摩诺之角”。实际上，这个神秘的物体是16年前“怪兽之日”事件后遗留下来的“怪兽之角”。在那次全球范围内同时出现怪兽的“怪兽之日”事件之后，怪兽灾害便成为了人们生活中司空见惯的一部分。为了应对这一威胁，日本的地球防卫队采取了武力手段来对抗怪兽，而专门的怪兽防灾科学调查所（简称SKIP）则致力于科学研究和避难引导，以防止怪兽灾害的进一步蔓延。至今，该组织仍在不断深入调查“怪兽之日”的原因以及城市中“摩诺之角”的秘密。
故事的主角是一个7岁的男孩，名叫优马。在一次与父母在狮子尾山露营的过程中，他们遭遇了怪兽的袭击，优马在这次惊险的经历中奇迹般地幸存下来，毫发无伤。这次事件深深触动了他，使他决心投身于怪兽生物学的研究之中。尽管经历了巨大的痛苦和恐惧，优马始终没有放弃自己的梦想，凭借着“想象的力量”不断成长，最终成为了一名新手调查员，加入了星元市分所的“SKIP”。
在怪兽灾害肆虐星元市的时刻，优马内心涌现出强烈的保护人们的决心。在他的脑海中，浮现出儿时曾见过的光之使者“卢提昂”的身影，卢提昂对他说：“我就是你，你就是我……释放你的想象力！”在这一瞬间，神秘的光芒包裹住了优马，释放出的想象之力将光与人结合，使他变身为守护未来的光之巨人“亚刻奥特曼”！从此，优马与亚刻奥特曼以及他的重要伙伴们一起，追逐梦想，展开了一段充满冒险与挑战的旅程。">
