《布莱泽奥特曼电影版:大怪兽首都激战》故事开始于某个工业地带陆陆续续出现怪兽的现象!弦人队长率领SKaRD进行迎击,成功打倒了接连出现的怪兽。SKaRD怀疑这些怪兽的出现与该地带的先进化学企业「尼克罗玛斯公司」有关,于是他们急忙前往该公司。这家公司是世界知名的化学研究机构,由最高运营者马布塞博士领导。
尼克罗玛斯公司的研究所正在开发一种被称为「达姆特辛」的长生不老物质,据说即将研发成功。然而,就在这时,一群自称为「宇宙霸者」的神秘宇宙人「达姆诺星人」出现在了地球上!更令人不安的是,达姆特辛物质泄露后吞噬了研究所的怪兽样本,孵化出了一只巨大且可怕的怪兽——妖骸魔兽贡吉尔冈。于是,日本的首都成为了这场大对决的舞台,布莱泽奥特曼和SKaRD将与这只巨大怪兽展开一场激烈的战斗!故事即将迎来高潮,让我们一起见证这场壮烈的大碰撞!">